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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一直以来都看作纸业原辅材料而被熟识的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“排泄固体废物”将成为“藏宝之小分子式”的辛酸史成长历程相同,终究会近十多年才被出现其根本的生物技术学用途,如果有一天“侧睡农奴把大合唱”,尤为是在免疫系统宫颈细菌感染性消化道问题学习领域内推陈出新。另一好几篇文献综述认知了在各种类型宫颈细菌感染性消化道问题的植物对模型中带来衣康酸或其耐腐蚀掩盖并衍生物技术的诊治益处,并出现其潜在的靶点。相对于衣康酸的“前世姻缘”与“这辈子”,详细文案《乳酸的奋斗史周围人——衣康酸!这篇文章让你认知衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用修饰语血清组学产品,实现1000+高妙度淡化位点查出,相对稳定重新原素靶点,全坐向生信了解解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看见”到“查验”全步骤服务质量,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、试验具体流程

02、实际统计数据

03、经“点”复现

在试验数据文件中,排除众多期刊论文中简报的经典爱情靶点简答衣康酸掩盖位点,如弟一些被察觉到的衣康酸共价掩盖蛋清酶KEAP1,还在糖酵解环路中的3个关健酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,同时炎性小体组合成蛋清酶NLRP3和神经细胞病变过程中 中的关健蛋清酶RIPK3等,其质谱图以下几点图如图。

04、设备特殊性

1.多厚质控

商家化炎症因子聊天探头孵育、SDS-PAGE查测、WB认可、范例涉及到性分享等双方向查测,确认的项目成果可靠的性。

2.高能质谱测量仪器APP

在Orbitrap Astral全新第二代高区分质谱仪加持咒下,保持衣康碱化突显位点及淀粉酶鉴定结论新层次,助推器科学技术调查新知道。

3.全方法一趟式服务于

特征提取拜谱生物体不断完善的实验所手机平台,可能提供“肿瘤细胞塑造培养→探头孵育→WB验测→深奥度衣康硝化作用修饰语验测→专用生信概述→特殊位点PRM确认”全步奏服務,省时省劲、方便更省钱。

05、研究资源(位置)

06、app位置

PART 2、文章分享到

专著一

英文翻译题目:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

简体中文文章标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

理论研究游戏内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

论文二

英语问题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

2英文题头:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

学习文章:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、例案延伸指导思想

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具有着较差的底物依照工作能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生态学衣康酸性反应绘制组实测值大数据中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应修饰语(有以下几点图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱工作小结

看作TCA循环法中的其中分泌物,衣康酸调低分泌、天然免疫抗体力和真菌感染区间内的充分效用,为的治疗方法天然免疫抗体力真菌感染性病展示了改用的治疗方法方法。衣康酸组成中的亲电性α,β-不呈现饱和状态羧酸组成能对核营养物质上的可溶性半胱氨酸残基开展烷基化装饰(迈克尔增加反應),这样译成后装饰被叫做“衣康酸装饰(itaconation)”,随之关系核营养物质模块,干预天然免疫抗体力对答和分泌渠道,为多样病抗癫痫药物开发展示新策略。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸遮盖蛋清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学界肯定酶联免疫法靶点新陈代谢组(QMT1000)或正能量基础消化吸收靶向治疗基础消化吸收组物料对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

考生文章

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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