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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网药剂学学阐释草酸钙肾结石脱色应激状态和疾病破损机理

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿设备的里普通的问题之首。肾阻止中CaOx氯化钠晶体过饱和沉积物会出现肾小管组织细胞直接损伤和凋亡,于是出现肾结石的转变成。短链人体脂肪多酸由肠内内好氧菌病毒腐熟膳食结构纤维素行成,不禁在位置肠内障壁中起着效用,然而在设备的技术上也起着的关键效用。表中,丁酸是最充沛的短链人体脂肪多酸,拥有消除炎症和天然免疫治理和改善效用,本理论研究研究丁酸对CaOx肾结石的效用还有潜在的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医疗泌尿急诊科吴忠专家教授、周子健博士生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠传授、周子健博后在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了微信网络药学学服务的,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

句子名稱:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 投资者方:华山医院口腔科 研究探讨群体:大鼠、HK-2内部 分组名称问题:对应组(Con)、仿真模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱提供数据系统:wifi网络临床药理学监测

要点程序图

研发没想到

探索技术人员首要实现大鼠模式,实现女性生理血生化指数公式和团体病症学染色的等探索策略看见丁酸会避免CaOx模式大鼠肾CaOx单晶体的行成和问题,改善CaOx模式大鼠的细菌感染问题和硫化物资的过早表达出。另外,丁酸还可促使草酸诱导性的HK-2細胞问题、硫化应激反应和細胞凋亡。 为与探讨丁酸框架和靶什么是染色体网,研究探讨人员管理从PubChem查看丁酸和丁酸酯的二维和三维空间框架(图1A)。能够 PharmMapper统计资料库和Uniprot统计资料库操作后共筛分出119个丁酸靶什么是染色体供进两步介绍。将什么是染色体列表页引入STRING统计资料库,进行PPI网介绍。Cytoscape做出了顺序的前20的核心站靶什么是染色体的基本网图,是指CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这样核心站什么是染色体与网中的各种什么是染色体均成绩出必然的相应的性,说明书怎么写这样什么是染色体能够挥发着协同作战使用。GO和KEGG介绍具体分析了丁酸核心站什么是染色体的相应的路径和海洋生态学功能性(图1C)。核心站什么是染色体其大部分与类固醇荷尔蒙初次回复、脱色无机化学症状应激性状态初次回复、活力性氧肿瘤细胞对类固醇荷尔蒙热血的无机化学症状和对弱酸性无机化学类物质的无机化学症状相关的英文。结合以上上述,这样核心站什么是染色体其大部分参与到了脱色无机化学症状应激性状态和对活力性氧的海洋生态学无机化学症状进程,是肾结石建立新机制中至关注重的路径,这体现了丁酸能够在肾结石中挥发注重使用。

图1| 丁酸组成部分与靶基因遗传网格浅析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进步探寻丁酸对CaOx肾结石.切靶DNA,深入解析考生充分利用GEO数据分析统计库对GSE73680中更健康比较与CaOx肾结石客户的DNA区别采取了深入解析。比较组与CaOx结石客户的明显性区别传达DNA(DEGs)建立规定为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个DNA情况明显转化,当中3379个(89.4%)DNA传达调涨,404个(10.6%)DNA传达下降(图2A)。对DEGs采取聚类分析算法解析,热图信息显示了前10个被选中DEGs的二维分层次聚类分析算法优点(图2B)。很快,深入解析考生根据GeneCards数据分析统计库人工服务签别了370个很有可能与CaOx肾结石有关的的DNA,排行榜前20位的精准预测DNA简述有关的性打分如图已知2C如图。从而找寻到丁酸改善CaOx肾结石的要素靶点,深入解析考生将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关的DNA处里收获了一大个Venn图。终究,CYP2C9被确保为丁酸损害CaOx肾结石的隐藏的靶点(图2D)。不但,深入解析考生还采取了丁酸与CYP2C9的氧分子交接,CYP2C9的四个有机酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸间接反应,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在充分利用互联网以及移动互联网的手段信息药剂学学预侧CYP2C9是丁酸危害CaOx肾结石的靶DNA后,理论研究工人还在组织受损细胞测试验证了CYP2C9可减低草酸引导的HK-2组织受损细胞的ROS能力、宫颈炎症伤害和凋亡。

图2| 占多数据库合作概述推测CYP2C9是丁酸用处于CaOx肾结石的靶遗传基因

研发最终

本研究探讨要阐明丁酸在休外和体内的均能阻止CaOx肾结石模形的腐蚀应激性状态和细菌感染直接挤压伤,其次使用wifi网药学学建立有丁酸的影响CaOx肾结石的潜在的靶点——CYP2C9,到最后使用癌人体细胞调查可确认CYP2C9在草酸盐成脂的HK-2癌人体细胞ROS情况、细菌感染直接挤压伤和凋亡。等阐明阐明丁酸可能性使用阻止CYP2C9来阻止CaOx肾结石的腐蚀应激性状态,消除细菌感染直接挤压伤。上述方式中拜谱生物制品的高技术可以提供了wifi网药学学的高技术开发于,最后拜谱生物制品的高技术可提升 较为成熟改善的dna组学、淀粉酶质组学、基础代谢组学等多个学护肤品及的高技术开发于,喜欢在线咨询在线咨询! 规范论文文献:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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