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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已界面显示出比较广泛的菌物可溶性，还有抗肉瘤和抗虫毒用处。常见，三萜是经由甲羟戊酸经由合成视频的，并从天然水植被和白色念珠菌中领取。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上发布了题写“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的探讨综述。该探讨出现三萜类单质野生野生灵芝酸（GA）是依据液滴致力于的无柄野生野生灵芝菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的生态学转变制造的。在转录组和血清质组学方法进两步找寻无柄野生虫草菌丝体中DHT制造俩种野生虫草酸（GA）的制度化，并通过多个学方法在线检测到的不一致性表观遗传和不一致性血清，得出DHT 生态学人工 GA 的前提条件。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录成分析和工作总类

根据对无柄灵芝粉白色念珠菌菌丝体完成转录组测序共收获67230个转录本和14295个单人类什么是基因组。在此类单人类什么是基因组中，49二个被评定为之间的关系形容出人类什么是基因组（DEGs），里面213个形容出调整，279个形容出上涨（图1A）。GO生物技术含有定量分享后，DEGs分类生物技术历程（BP）、神经元含量（CC）和原子核能力（MF）3类。在BP门类中，显现了前三种子门类：抗生素类进行分解分解消化吸收历程，乙酸盐分解消化吸收历程和甲酸盐分解消化吸收历程;而在CC门类中，神经元外区、突触挽回体、突触空间结构是前三种亚类。谈谈MF门类，甲酸脱氢酶（NAD）渗透性酶类、氧化物呈现酶渗透性酶类和酸氨（或酰胺）接触酶渗透性酶类是前三种亚门类（图1B）。在DEGs的KEGG通道定量分享中，前30条生物技术含有度极高的通道有27条属分解消化吸收，里面二氧化氮分解消化吸收、乙醛酸盐和二羧酸盐分解消化吸收、丙酸盐分解消化吸收信号灯通道差异性生物技术含有（图1D）。

图1|转录混合物析和功能性分类管理

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

顺利经过对无柄野生灵芝念珠菌菌丝体实行核血清酶质组学概述，共分选择了16,457种个性肽、2606种核血清酶质和2588种一定量核血清酶质。在阈值法|FC|>1.2和p<0.05的挑选要求下，你不在2606种核血清酶质中，94种被技术鉴定为异同把你想描述出来核血清酶（DEPs），进来52种调整，42种调整（图2A），图2C现示了异同把你想描述出来核血清酶的聚类讲解法概述热图。从GO概述看来，BP品目现示，几乎数DEPs经过醋酸钠盐分泌的进程中、抗菌素分离分泌的进程中和用药分离分泌的进程中。CC类DEPs在受损血细胞核系外区、过空气氧化物质物酶体和微体中增长率最底，空气氧化物质重置酶可溶性和甲酸脱氢酶（NAD）可溶性在MF类中DEPs的比例怎么算最底（图2B）。与转录组效果同类，KEGG预警信号通路概述现示，多个DEPs在分泌中丰度，进来3条最丰度的有效途径是光合海洋生物技术中的碳固定不变、碳分泌和MAPK预警预警信号通路（图2D）。另外，顺利经过概述GO统计资料库的CC对DEPs实行亚受损血细胞核系产品定位概述和引用（图2E），DEPs主要的的遍布在受损血细胞核系质（40.66%）、受损血细胞核系膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），学说上是GAs海洋生物技术获得的主要的的地点。

图2|核蛋白组的酶联免疫法探讨和性能认证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

为业物导出和對照组得票数DEGs和DEPs加工制作了维恩图，有20个中的关系抒发出染色体（图3A）。对转录组和球球血清组中E组和C组共计的DEGs/DEPs参与聚类研究法研究，出现 mRNA和球球血清中有19个调整染色体和9个调整染色体，DEGs与之译文资料的DEPs抒发出能力呈正涉及到的的的，研究背景Pearson的涉及到的的的比率研究，在转录组和球球血清组中检查到比较高的涉及到的的的性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）论文检测结论表明，E组和C组17个DEGs的展示水准不同之处可观，这当中9个为调整DEGs，8个为调低DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的展示趋势英文与转录酚类化合物析结论高度。

图3|血清质组的酶联免疫法研究分析和模块认可

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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