
单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抵抗能力植物物种特女性朋友、寡核苷酸装饰料工费高或进行操作过程有难度。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯讲师团队合作在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低代价、跨种类、全网络平台兼容的全新解决方案。
杂志期刊简洁
Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由中科学学学合理院显性基因与阴茎发育动物学科研所和中显性基因懂得牵头的香港国际科研中文核心杂志期刊论文杂志,迫切需要于报到寿命科学学学合理和药学显性基因学这个科技域的原创度性科研成果。JGG 2026年度干扰细胞7.1,Scopus科研中文核心杂志期刊论文杂志评价语指标值CiteScore 9.9,位居JCR 2026年度GENETICS & HEREDITY这个科技域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY这个科技域Q1区,位居中科学学学合理院中文核心杂志期刊论文杂志系统盘动物学类1区(Top中文核心杂志期刊论文杂志),显性基因学和什么是生化与碳原子动物学小类双1区。BIOPROFILE
哪些是HEATag
恰当的“二一体”设置
HEATag是由凝集素和HUH内切酶组成部分的容合淀粉酶
「固定器」控制模块 - 凝集素
能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化淡化(如GlcNAc和Neu5Ac)。
「联接器」电源模块 - HUH内切酶
可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)字段长条码来共价相连。
“1+1>2”的目的:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样板标记图片与溯源系统。
Fig1: HEATag几斤标上工作原理图示图
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初级教程定期检查
HEATag究竟有大多能打?
能够 在多种标准下,确保蒲乳期宠物人体细胞膜系单人体细胞膜混样测序
实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。钻研开发团队为 HEATag 快速设置了多轮 “压力差考试”,从受损细胞质系到受损细胞质核,从常温下到高温,从新鲜样本量量到确定样本量量,全坐向认可它的安全性和正规性。
一是轮试验面对喂奶小动物癌上皮内部系:探析人使用了基人、鼠、仓鼠3个动物群的四种方式癌上皮内部(HEK293T、K562、MEF、CHO),在制冷下要 HEATag 符号后相溶测序。之后回收并的 11447 个癌上皮内部中,85.66% 都能使用 HEATag 条型码准确的连接到原动物群,范本间相交的污染极低,UMAP 聚类算法深入分析还有马上认定书,HEATag 条型码与动物群特情人dna组特征描述超高同步。 没过多久,软件测试先决环境进那步上升:调查成员体验在 4℃下标示新的松茸神经神经体上皮细胞膜、在温度下标示甲醇固定住的神经神经体上皮细胞膜,以及同时标示神经神经体上皮细胞膜核。没想到照样真视:各个先决环境下,样品标鉴与种类资料均极具好的重要性性,分割明确率超 95%。就算甲醇固定住的会致使经微的转录本交叉的情况被污染,神经神经体上皮细胞膜核分离纯化就会一少部分 RNA 轻易流失,神经神经体上皮细胞膜型号的引用没想到照样与新的松茸样品持续相一致,关系证明 HEATag 不错标示不同于解决先决环境下的进行实验样品。
Fig2: HEATag 可在各个标准下做好单生殖细胞转录组混样具体分析
要标记图片辅乳期生物和海洋生物无脊柱生物的原代神经细胞
如果你上皮组织细胞系检测是 “依据题”,那策划 范例这就是 “增添题”, 哪些范例经常因上皮组织细胞类行非常复杂、自然环境适应环境性独特,加入标识技术设备的 “问题”,而 HEATag 恰巧在哪些 “问题” 上展示了优劣势。研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸集体,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不单能被精确性区分处理,每个一般细胞膜形式的聚类分析结局都流畅可辨。
更令人惊喜的是HEATag对海洋资源生物学的更换性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 方形码与外来物种转录组享有较高保持独立性,找不到有因高盐条件促使的 “标示不起作用”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。
Fig3: HEATag 可完成蒲乳期生物机构样例多厚 scRNA-seq 进行分析
Fig4: HEATag可实行优质浮游生物无脊柱生物几斤 scRNA-seq 介绍
HEATag与组织的运用不会轻易进而引发转录组的强势该变
对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在完毕标志成就的另外,不懂对事件调查的转录成分析会导致侵扰,保持了科学研究数据库的真正性。
Fig5: HEATag没有会影响样版的 RNA 展示形式
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中国来日可期
HEATag 能为单细胞核探讨产生有什么?
HEATag 的附加值,远止不住于 “解决处理标注问題”,它的敏锐性和共通性,在为单生殖细胞设计打开文档更加多机会性
从app场地来瞧
HEATag 能包括从 “方便会比较定性分析”(如癌团体机构与一般团体机构、药物治疗加工与相较比较)到 “十万人化探究”(如团体机构神经元图谱作图、高通芯片量挑选)的全使用范围需求量。逐渐 PIP-seq、Stereo-cell 等创新可扩容高技术的壮大,HEATag 还能逐步一个脚印提升自己单神经元探究的通量,推动科学研究创业团队进行更十万人化的顶目。从跨层面发展潜力去看
HEATag 不但适在于转录组学,还能与表观遗传基因组学、蛋白酶质组学、成长空间组学等方法依照,按照个人定制指数和寡核苷酸队列,HEATag 应该快速靠拢不一样的的组学具体步骤,不导致信息采集深度的。时,因为HEATag还应该成长单体细胞糖组学探讨方法。BIOPROFILE
加盟各式各样
拜谱生物体与陈凯专家教授实现阶段合作共赢项目合作
值得一看注重的是,在 HEATag 高高技术性展出现出巨大的软件应用前景的背景图片下,拜谱物理学制品已与南方城市大海科学的研究与建设工程广西测试操作室(长沙 )陈凯先生完成率开始达成合作合作协议。夫妻两人计划书围绕着 HEATag 高高技术性的高新产业完美落地、科技创新流量转化等方位而铺展开的宽度协同,推动了此种低价格、跨种类的单癌体细胞核标出高高技术性最快软件应用于具体科技创新不一样,为大量的测试操作室出具有效、资金的单癌体细胞核的研究软件,推助科技创新事情者在癌体细胞核物理学制品学、大海物理学制品学、肠道疾病规则等各个领域拿到大量的的提升